Wkrótce po założeniu parafii, przed rokiem 1595, wzniesiono drewniany kościół dedykowany Świętej Trójcy. Był to pierwszy etap rozwoju duchowego miejsca, które z czasem stało się centrum religijnym dla mieszkańców okolicy. Przez wieki kościół ten był świadkiem licznych wydarzeń, zmieniając się i ewoluując wraz z potrzebami parafian.

Przełomowym momentem w historii parafii było wzniesienie w 1891 roku nowego, murowanego kościoła na miejscu starej, drewnianej świątyni. Nowy kościół, poświęcony w roku następnym, a konsekrowany w 1899 roku, stał się nowym duchowym domem dla wiernych, symbolizując trwałość i nieprzemijalność wiary.

Zabratówka, będąca częścią parafii Woli Rafałowskiej od jej początków, również odegrała ważną rolę w historii parafii, aż do momentu erygowania tam osobnej parafii w 1973 roku. Ta zmiana podkreślała wzrost i rozwój lokalnej wspólnoty katolickiej.

Ważnym wydarzeniem dla parafii było poświęcenie kaplicy cmentarnej na cmentarzu w Woli Rafałowskiej przez Ks. Bpa Kazimierza Górnego 17 października 2002 roku. Ten akt poświęcenia nie tylko wzbogacił życie duchowe parafii, ale także uświadomił ważność miejsca pochówku jako przestrzeni pamięci i modlitwy.

Historia parafii w Woli Rafałowskiej jest przykładem, jak wiara, tradycja i zaangażowanie społeczności mogą tworzyć trwałe i żywe miejsce kultu, które przez pokolenia służy jako przestrzeń dla duchowego wzrostu, modlitwy i pamięci.