Już od roku 1595 przy parafii działała szkoła parafialna, co świadczy o długoletnim zaangażowaniu w edukację i wychowanie młodzieży w duchu chrześcijańskim. Kościół parafialny pod wezwaniem św. Bartłomieja, wzniesiony w XVI wieku, był świadkiem wielu przebudów, z których każda dodawała mu unikalnego charakteru. Pierwsza polichromia, datowana na XVI wiek, oraz kolejna z 1939 roku, zdobią wnętrze kościoła, stanowiąc o jego historycznym i artystycznym znaczeniu.

Na przełomie XX i XXI wieku parafia podjęła ambitne zadanie budowy nowego kościoła parafialnego pod wezwaniem Miłosierdzia Bożego. Prace rozpoczęte przez ks. Józefa Głowę w kwietniu 1990 roku według projektu inż. Witolda Drzymalskiego, a kontynuowane przez ks. Kazimierza Rzońcę, zaowocowały wzniesieniem nowoczesnej świątyni. Kamień węgielny, poświęcony przez św. Jana Pawła II, został wmurowany w czerwcu 1992 roku przez bp. Kazimierza Górnego, co stanowiło symboliczny początek nowego etapu w historii parafii.

Kościół pobłogosławił bp Edward Białogłowski w sierpniu 1994 roku, a uroczystego poświęcenia dokonał bp Kazimierz Górny, Biskup Rzeszowski, w kwietniu 2007 roku. Nowa świątynia nie tylko odzwierciedla rozwój architektoniczny i duchowy parafii, ale również staje się miejscem spotkań i modlitwy dla wiernych, kontynuując misję parafii Wójtowa w nowym tysiącleciu.

Tak bogata historia parafii Wójtowa jest przykładem nieustającej wiary i determinacji jej mieszkańców, którzy przez wieki budowali i rozbudowywali swoje duchowe dziedzictwo, tworząc przestrzeń do celebracji wiary i wspólnoty.